林钰祥也回忆，他当“立委”有次向“行政院长”郝柏村口头质询时，因为多次去过大陆看了以后，认为大陆改革开放、建设效率高，这个优点台湾不能不注意，结果强烈反共的郝柏村一下子就说，不要因为被茅台酒灌、请吃饭，就说他们的好话，形成一个比较尴尬的场面。其实原因之一也是对“集思会”有敌意，跟当时报道所谓的“一国两府”辩论没有关系，“集思会”当时走两岸交流路线也完全跟是否是李登辉或国民党授意肯定没有关系，完全是他自己想的，而且提出“一国两府”是在“集思会”成立之前。
林钰祥说，“集思会”的前几年是走在民进党、本土派之前的，现在台联则是走到比民进党更独的立场，“集思会”比当时新国民党连线走得更前面，李庆华也走那边，但是本土派是走在前面的，黄主文后来离开，为了要生存，走到深绿去了，如果把“集思会”跟黄主文连在一起，那就是大错特错。
此外，林钰祥也说，台湾政府一开始制定两岸人民关系条例条文时，“立委”从第一条到最后95条的审查，他全程参与。马英九是“陆委会副主委”代表答辩，虽然很多条文是比照国际上的做法，但是办法是换上不同的名称，不是国对国，解决两个地区人民往来的问题，他与马英九互动交手时，都是直接交换意见，并没有什么直接的冲突。
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